由于馬鈴薯聯合收獲機在結束收獲工作后，機具上會沾染上許多泥土及雜草，如果長期不進行清理的話，則有可能會導致馬鈴薯聯合收獲機發生故障，影響正常操作使用。因此，為了避免這種情況的發展，需要對馬鈴薯聯合收獲機進行定期清潔保養。
一般情況下，馬鈴薯聯合收獲機在結束工作后，要對機具各部位的泥土進行清理，不要等到土干了再進行清理。除此之外，還需要對馬鈴薯聯合收獲機各部位的緊固件進行定期檢查，如果發現有松動的情況，則需要及時緊固，以免后期使用時，由于零部件的松動造成危險。在使用馬鈴薯聯合收獲機前，也需要進行全面的檢查，這不僅是為了保障操作人員自身的安全，同時也是為了避免馬鈴薯聯合收獲機一開始工作就發生故障，造成一定的損失。